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Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie

L’approche majeure pour résoudre la structure tridimensionnelle de macromolécules biologiques est la cristallographie aux rayons X. Ce MOOC est une initiation complète à la cristallographie biologique : depuis l’histoire de la méthode jusqu’à ses outils concrets.

L’utilisation des structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques fait partie du quotidien d’un grand nombre de biologistes. Ces structures permettent de comprendre leur fonctionnement, de dessiner des mutants pour étudier leur fonction, de dessiner des molécules pour les bloquer ou les activer.

A la fin de ce MOOC vous serez capable :

– d’exploiter les structures tridimensionnelles avec un bon sens critique,

– de résoudre la structure tridimensionnelle d’une macromolécule par cristallographie.

Nous vous transmettons nos connaissances et notre expérience par le biais de vidéos théoriques et en situation.

Organisateur :

Université Paris-Saclay

* MOOC Francophone est un service de mise en relation sans inscription et sans intermédiaire. Nous n’organisons aucun cours, le lien « Suivre le cours » vous redirige vers la page web des organisateurs.
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    Intervenant

    MARIE-HÉLÈNE LE DU

    Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

    JEAN-BAPTISTE CHARBONNIER

    Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

    PIERRE LEGRAND

    Scientifique de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL

    YVES MECHULAM

    Directeur de Recherche au CNRS, Professeur à l’Ecole polytechnique

    SYLVAIN RAVY

    Directeur de Recherche au CNRS Laboratoire de Physique des Solides, Université Paris-Sud

    SERENA SIRIGU

    Scientifique de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL

    Experts
    STÉPHANE BRESSANELLI

    Directeur de recherche au CNRS, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

    LÉONARD CHAVAS

    Responsable de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL

    BRUNO ROBERT

    Directeur de recherche au CEA, responsable du département biochimie, biophysique et biologie structurale à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

    CARINE TELLIER

    Assistante Ingénieur au CEA, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule

    ANDREW THOMPSON

    Directeur scientifique du synchrotron SOLEIL

    SOPHIE ZINN-JUSTIN

    Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)

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    Durée

    5 semaines
    Du 6 novembre au 10 décembre 2017

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    Prérequis

    Ce MOOC est conçu pour des étudiants en biologie à partir du niveau Master, des étudiants en thèse, des stagiaires postdoctorants, des ingénieurs ou chercheurs en biologie.
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    Charge de travail

    3 heures / semaine

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    Coût

    Gratuit

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    Certification

    Oui

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    Déroulement

    Deux types d’évaluations vous seront proposées :

    Un quizz à la fin de chaque chapitre
    Une évaluation par les pairs lors de la dernière semaine
    Une attestation de suivi avec succès sera délivrée pour tous les apprenants ayant eu au moins 60% de bonnes réponses aux quizz et à l’évaluation finale

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    Programme

    1. Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques
      • Des structures tridimensionnelles : pourquoi faire ?
      • Des structures tridimensionnelles : comment faire ?
    2. Les fondamentaux de la cristallographie
      • Histoire de la cristallographie aux rayons X
      • Pourquoi et comment produire des rayons X ?
    3. L’échantillon : de sa production à sa cristallisation
      • Préparer son échantillon biologique
      • Cristalliser une macromolécule biologique
    4. Une semaine sur une ligne de lumière du synchrotron SOLEIL
      • L’acquisition des données de diffraction
      • Le traitement des données de diffraction
    5. Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques
      • Le problèmes des phases
      • La résolution de la strucure cristallographique
      • La construction, l’interprétation et l’analyse du modèle
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    Plateforme

    France Université Numérique (FUN)
    Plate-forme nationale française et propriété du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Elle est basée sur la technologie Open edX du MIT et de Harvard.

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  • La durée des modules et le rythme de travail sont conformes à mes attentes.
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  • Les ressources sont utiles et le contenu des modules est pertinent.
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  • Les activités proposées facilitent la compréhension du cours
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  • Les évaluations permettent de mesurer votre progression dans ce cours
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  • Les échanges avec l’équipe pédagogique correspondent à vos besoins
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  • Les interactions entre utilisateurs représentent une véritable valeur ajoutée
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  • L’accès à la plateforme est simple, sa prise en main intuitive et la navigation facile
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