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Bioinformatique : algorithmes et génomes

MOOC Bioinformatique : algorithmes et génomes

Le MOOC Bioinformatique : algorithmes et génomes vous présentera comment l’informatique contribue à l’interprétation du « texte » des génomes. Les différentes séances vous apporteront les connaissances nécessaires à la compréhension des entités et processus biologiques impliqués dans la génomique et proposeront conjointement une introduction à l’algorithmique sur les séquences de caractères qui, dans ce contexte, représentent l’information génétique.

Ce cours abordera le codage et l’exploitation par la cellule de l’information génétique, la prédiction de gènes, la comparaison de séquences, la reconstruction d’arbres phylogénétiques. Les algorithmes de base impliqués dans ces démarches seront présentés. Ce cours s’adresse à toute personne souhaitant découvrir l’analyse informatique de l’information génétique et acquérir les notions de base à l’interface de la génomique et de l’algorithmique.

Organisateur :

INRIA

* MOOC Francophone est un service de mise en relation sans inscription et sans intermédiaire. Nous n’organisons aucun cours, le lien « Suivre le cours » vous redirige vers la page web des organisateurs. Les participants peuvent également évaluer ce cours en cliquant ici
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    Intervenant

    François Rechenmann
    Directeur de recherche chez Inria pendant plus de 30 ans, François Rechenmann a créé la première équipe-projet Inria dédiée à ce domaine de recherche. Par la suite, il a rejoint l’équipe Ibis, qui se consacre à l’étude de la dynamique des réseaux moléculaires. Il est aujourd’hui directeur général de l’entreprise de bioinformatique Genostar.

    Thierry Parmentelat
    Ingénieur de recherche chez Inria. Thierry a mené une carrière hybride entre les mondes académique et industriel. Ses centres d’intérêt couvrent les langages de programmation, les réseaux, et l’algèbre. Il utilise Python depuis plus de 10 ans pour ses travaux de recherche, ainsi que pour le développement des plateformes expérimentales dont il a la charge.

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    Durée

    5  semaines
    Du 15 mai au 18 juin 2017

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    Prérequis

    Une culture scientifique de niveau bac scientifique facilitera la compréhension des notions abordées.

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    Charge de travail

    2 heures / semaine

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    Coût

    Gratuit

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    Certification

    Attestation de suivi avec succés
    Elle sera délivrée sous réserve d’obtention d’un score minimal de 60% aux quiz proposés.

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    Déroulement

    Cours hebdomadaire sur 5 semaines.

    Chaque semaine est composée de 10 séquences contenant chacune une vidéo, soit une dizaine de vidéos d’environ 6 minutes.

    Des quizz sont associés aux séquences, ainsi que des supports de cours et des activités ou informations complémentaires.

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    Programme

    Semaine 1 : ADN et séquences génomiques
    Semaine 2 : Gènes et protéines
    Semaine 3 : Prédiction des gènes
    Semaine 4 : Comparaison de séquences
    Semaine 5 : Arbres phylogénétiques

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    Plateforme

    France Université Numérique (FUN)
    Plate-forme nationale française et propriété du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Elle est basée sur la technologie Open edX du MIT et de Harvard.

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