L’approche majeure pour résoudre la structure tridimensionnelle de macromolécules biologiques est la cristallographie aux rayons X. Ce MOOC est une initiation complète à la cristallographie biologique : depuis l’histoire de la méthode jusqu’à ses outils concrets.
L’utilisation des structures tridimensionnelles de macromolécules biologiques fait partie du quotidien d’un grand nombre de biologistes. Ces structures permettent de comprendre leur fonctionnement, de dessiner des mutants pour étudier leur fonction, de dessiner des molécules pour les bloquer ou les activer.
A la fin de ce MOOC vous serez capable :
– d’exploiter les structures tridimensionnelles avec un bon sens critique,
– de résoudre la structure tridimensionnelle d’une macromolécule par cristallographie.
Nous vous transmettons nos connaissances et notre expérience par le biais de vidéos théoriques et en situation.
Intervenant
MARIE-HÉLÈNE LE DU
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
JEAN-BAPTISTE CHARBONNIER
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
PIERRE LEGRAND
Scientifique de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
YVES MECHULAM
Directeur de Recherche au CNRS, Professeur à l’Ecole polytechnique
SYLVAIN RAVY
Directeur de Recherche au CNRS Laboratoire de Physique des Solides, Université Paris-Sud
SERENA SIRIGU
Scientifique de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
Experts
STÉPHANE BRESSANELLIDirecteur de recherche au CNRS, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
LÉONARD CHAVAS
Responsable de ligne sur PROXIMA-1, synchrotron SOLEIL
BRUNO ROBERT
Directeur de recherche au CEA, responsable du département biochimie, biophysique et biologie structurale à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
CARINE TELLIER
Assistante Ingénieur au CEA, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
ANDREW THOMPSON
Directeur scientifique du synchrotron SOLEIL
SOPHIE ZINN-JUSTIN
Chercheur au CEA, responsable d’équipe à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC)
Durée
5 semaines
Du 6 novembre au 10 décembre 2017Prérequis
Ce MOOC est conçu pour des étudiants en biologie à partir du niveau Master, des étudiants en thèse, des stagiaires postdoctorants, des ingénieurs ou chercheurs en biologie. Charge de travail
3 heures / semaine
Coût
Gratuit
Certification
Oui
Déroulement
Deux types d’évaluations vous seront proposées :
Un quizz à la fin de chaque chapitre
Une évaluation par les pairs lors de la dernière semaine
Une attestation de suivi avec succès sera délivrée pour tous les apprenants ayant eu au moins 60% de bonnes réponses aux quizz et à l’évaluation finaleProgramme
- Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques
- Des structures tridimensionnelles : pourquoi faire ?
- Des structures tridimensionnelles : comment faire ?
- Les fondamentaux de la cristallographie
- Histoire de la cristallographie aux rayons X
- Pourquoi et comment produire des rayons X ?
- L’échantillon : de sa production à sa cristallisation
- Préparer son échantillon biologique
- Cristalliser une macromolécule biologique
- Une semaine sur une ligne de lumière du synchrotron SOLEIL
- L’acquisition des données de diffraction
- Le traitement des données de diffraction
- Structures tridimensionnelles des macromolécules biologiques
- Le problèmes des phases
- La résolution de la strucure cristallographique
- La construction, l’interprétation et l’analyse du modèle
Plateforme
France Université Numérique (FUN)
Plate-forme nationale française et propriété du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Elle est basée sur la technologie Open edX du MIT et de Harvard.
Taux de satisfaction
Votre perception du cours doit rester constructive. Nous encourageons un débat sain et constructif entre concepteurs de MOOC et utilisateurs. Les avis sont modérés avant publication et les données sont anonymisées après contrôle. Pour évaluer ce cours, cliquez sur le lien bleu - Je participe ! - et validez votre accord avec chacune des affirmations sur une échelle de 1 à 100. Merci de votre compréhension !